Programme

Lundi 13 décembre 2021

  • 14h 15 - 14 h 30 : Ouverture et introduction.
    Didier Rebeix, Mésocentre de l’Université de Bourgogne, Dijon
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  • 14 h 30 - 14 h 55 : 100 To de tuberculose, pour quoi faire ?
    Christophe Guyeux, Département d'Informatique des Systèmes Complexes  (FEMTO-ST/DISC), Université de Technologie de Belfort-Montbeliard, Ecole Nationale Supérieure de Mécanique et des Microtechniques, Université de Franche-Comt&eacute.
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  • 14 h 55 - 15 h 10 : MSSEG-2: Un challenge en traitement d'images médicales sur VIP.
    Sorina Pop  1, Axel Bonnet  1, Arthur Masson  2, Michael Kain  2, Michel Dojat  3, Olivier Commowick  4, Frederic Cervenansky  1

    1 : CREATIS, Univ. Lyon, INSA‐Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, UJM-Saint Etienne, CNRS, Inserm
    2 : Inria Rennes – Bretagne Atlantique
    3 : Grenoble Institut des Neurosciences, CHU Grenoble, Inserm, Université Grenoble Alpes
    4 : VISAGES : Vision Action et Gestion d'Informations en Santé, Inserm, Inria, CNRS
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  • 15 h 10 - 15 h 25 : Passage à l'échelle d'un algorithme de Randomized SVD pour la caractérisation du vivant par méthode de positionnement multidimensionnel.
    Emmanuel Agullo  1, Olivier Coulaud  1, Mathieu Faverge  1 , Alain Franc  2,Jean-Marc Frigerio 2,Florent Pruvost  1

    1 : Inria, Université de Bordeaux, CNRS, Bordeaux INP
    2 : BIOGECO, INRAE, Université de Bordeaux, Pleiade team Inria - INRAE Bordeaux-Sud-Ouest
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  • 15 h 25 - 15 h 50 : EUROPEAN OPEN SCIENCE CLOUD
    Volker Beckmann, MESRI
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  • 15 h 50 - 16 h 15 : Pause
  • 16 h 15 - 16 h 40 : Présentation de DDOR CNRS
    Denis Veynante, DDOR, CNRS
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  • 16 h 40 - 16 h 55 : SSHAM on IDRIS
    Ludovic BILLARD, Guillaume HARRY, Institut du développement et des ressources en informatique scientifique
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  • 16 h 55 - 17 h 10 : Protein-Ligand binding affinity prediction using combined molecular dynamics and deep learning approaches
    Pierre-Yves Libouban  1, Samia Aci-Sèche  1, Gary Tresadern  2, Pascal Bonnet  1

    1 : Institute of Organic and Analytical Chemistry (ICOA), Université d'Orléans, CNRS
    2 : Computational Chemistry, Janssen Research&Development, Belgium
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  • 17h10 - 17 h 35 : Gestion et exploitation de données COVID (images et cliniques)
    Tiphaine Diot  1, Olivier Bernard  1, Pierre Croisille  1  2, Frederic Cervenansky 1

    1 : CREATIS, Univ. Lyon, INSA‐Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, UJM-Saint Etienne, CNRS, Inserm
    2 : Service de radiologie, CHU Saint-Etienne
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  • 17 h 35 - 18 h : How to split a terapolynomial ?
    Francois Vigneron  1, Nicolae Mihalache  2

    1 : Université de Reims Champagne Ardenne, CNRS
    2 : Université de Paris-Est Creteil, CNRS
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Mardi 14 décembre 2021 - matin

  • 9h - 9 h 15 : Transformation des moyens de calcul de l'Inria
    Lucas Nussbaum, INRIA
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  • 9 h 15 - 9h30 : Vers une offre de service "informatique scientifique" à l'Inserm
    Gilles Mathieu, Daniel Salas, Yosra Sanaa, Dominique Pigeon, Fanny Brizzi, Département du Système d'Information de l'INSERM
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  • 9 h 30 - 9 h 45 : PCSC : le Portail pour le Calcul, le Stockage et le Cloud
    Pierre Adenot 1, Estelle Ancelet 2, Sophie Aubin 3, David Benaben  4, Damien Berry  2, Emmanuel Braux 5 , Éric Cahuzac 5, Patrick Chabrier 2, Alexandre Dehne-Garcia  3, Frédéric de Lamotte 6, Lise Frappier 3, Pierre Gay 5, Loïc Houde 8, Pierre-Emmanuel Guerin 9, Arnaud Jean-Charles 10, Cyril Jousse 11, Anne Laurent 12, Emilie Lerigoleur 13, Benjamin Marguin 14, Gilles Mathieu 15, Vincent Nègre 16, Nadia Ponts 17, Tovo Rabemanantsoa 3& 18, Richard Randriatoamanana 9& 19, Jean-François Rey  8, Fabrice Roy 20, Sandrine Sabatié 21, Daniel Salas 15, Martin Souchal 22,  Florian Trincal 23, Zenaid

    1 : UMR 1198 BREED, Biologie de la Reproduction, Environnement, Epigénétique & Développement, INRAE
    2 : UR 0875 MIAT, Mathématiques et Informatique Appliquées Toulouse, INRAE
    3 : INRAE, UAR1479 DipSO Direction pour la Science Ouverte
    4 : UMR1332 BFP, Biologie du Fruit et Pathologie, INRAE
    5 : IMT Atlantique
    6 : UMR 1334 AGAP, Amélioration Génétique et Adaptation des Plantes méditerranéennes et Tropicales, INRAE
    7 : MCIA, Université de Bordeaux
    8 : UR 0546 BioSP, Biostatistique et Processus Spatiaux, INRAE
    9 : ICI, Centrale Nantes
    10 : Labex DRIIHM, Aix-Marseille Université
    11 : Institut de Chimie de Clermont-Ferrand, CNRS, Université Clermont Auvergne, Institut national polytechnique Clermont Auvergne, Université Clermont Auvergne
    12 : LIRMM, Montpellier Polytech, Université de Montpellier
    13 : Géographie de l'environnement, CNRS, Université Toulouse - Jean Jaurès
    14 : Makina Corpus
    15 : DSI, INSERM
    16 : UMR 0759 LEPSE, Laboratoire d'Ecophysiologie des Plantes sous Stress environnementaux, INRAE
    17 : UR 1264 MycSA, Mycologie et Sécurité des Aliments, INRAE
    18 : UMR 1391, ISPA Interaction Sol Plante Atmosphère, INRAE
    19 : UMR6004 Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes, Université de Nantes
    20 : UMR 8102 LUTH, Laboratoire Univers et Théorie, Université de Paris
    21 : UR 1456 ETBX Environnement, territoires et infrastructures, INRAE
    22 : AstroParticule et Cosmologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives, IN2P3, Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres, CNRS, Université de Paris
    23 : UAR 1420 DSI-INFRA DSI-Solutions d'Infrastructures Informatiques et Services, INRAE
    24 : UMR 5319 Passages, CNRS
    25 : IGF, Institut de Génomique Fonctionnelle, CNRS, INSERM, Université de Montpellier
    26 : GENCI
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  • 9 h 45 - 10 h 25 : Lightning talks et posters - Vidéo - Le tour des posters

      • Groupe de travail MésoTech - Poster
        Béatrice Charton1, Arnaud Renard2

         1 : Centre Régional Informatique et d'Applications Numériques de Normandie
         2 : Université de Reims

      • EOSC-Pillar Ambassador Programme - Poster
        Gilles Mathieu, Yosra Sanaa

         Département du Système d'Information de l'INSERM

      • Une utilisation concrète d'EOSC : Cas d'usage en bioinformatique dans le cadre du projet EOSC-Pillar - Poster
        Gilles Mathieu, Yosra Sanaa

         Département du Système d'Information de l'INSERM

      • CSAN : Comprehensive Software Archive Network - Poster
        Martin Souchal  1, Alexandre Dehne-Garcia  2, Jérôme Pansanel  3 , Richard Randriatoamanana  4, Pavel Zakharov  1, Remy Dernat  5, Tovo Rabemanantsoa

         1 : AstroParticule et Cosmologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives, IN2P3, Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres, CNRS, Université de Paris
         2 : Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques, INRAE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier
         3 :  Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien (IPHC), CNRS, Université de Strasbourg
         4 : Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes (LS2N) du CNRS et de son partenaire INRIA, Université de Nantes, Ecole Centrale de Nantes, IMT Atlantique Bretagne-Pays de la Loire
         5 : Institut des Sciences de l’évolution de Montpellier, Ecole Pratique des Hautes Etudes, Université Paris sciences et lettres, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, CNRS, Université de Montpellier, Institut de recherche pour le développement
         6 : Direction pour la Science Ouverte, INRAE

      • HW/SW co-design pour SKA - Poster
        Shan Mignot

        Laboratoire Lagrange, Observatoire de la Cote d'Azur, Université Côte d'Azur (UCA), Institut national des sciences de l'Univers

      • Towards an exascale computing to recover the crustal Earth physical properties using the full seismic waveform inversion - Poster
        Alizia Tarayoun 1, Romain Brossier 1, Ludovic Métivier 1 2

         1 : Institut des Sciences de la Terre, Institut National des Sciences de l'Univers, Institut de recherche pour le développement, Université Grenoble Alpes, Université Gustave Eiffel, CNRS, Université Savoie Mont Blanc
         2 : Laboratoire Jean Kuntzmann, Inria, CNRS, Université Grenoble Alpes, Institut polytechnique de Grenoble
  • 10 h 25 - 10 h 50 : Pause
  • 10 h 50 - 11 h 15 : Quelle place pour les mésocentres de calcul et de traitement de données au sein de la transformation numérique ?
    Guillaume Aulanier (Chargé de Mission « calcul ») et Laurent CROUZET, MESRI
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  • 11 h 15 - 11 h 40 : Recherche Data Gouv : une plateforme nationale fédérée des données de la recherche, dans le contexte du Plan national pour la science ouverte et de la politique des données , des algorithmes et des codes sources de l’ESR.
    Isabelle Blanc, MESRI
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  • 11h 40 - 12 h 05 : Point d’actualité de GENCI dans l ’écosystème HPC/HPDA/IA/Q
    Philippe Lavocat, GENCI
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  • 11h 40 - 12 h 05 : MesoNET : le mésocentre national distribué"
    Jean-Philippe Proux1, Arnaud Renard2
    1 : GENCI
    2 : Université de Reims
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  • 12 h 05 - 14 h : Pause déjeuner

Mardi 14 décembre 2021 - après midi

  • 14h - 14 h 25 : Etude de performances aérodynamiques d'ailes d'A320 par déformation électro-active, bénéfices d'une approche centrée sur les données
    Marianna Braza  1, Jean Baptiste Tô  1, César Jimenez Navarro  1, Clément Rouaix  1, Thierry Louge  2, Nicolas Renon  2, Abderahmane Marouf

    1 : Institut de Mécanique des Fluides de Toulouse, CNRS, Université Paul Sabatier, Institut National Polytechnique de Toulouse
    2 : Calcul en Midi-Pyrénées, INSA - Toulouse, Université Toulouse III - Paul Sabatier, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, PRES Université de Toulouse, CNRS, Institut National Polytechnique (Toulouse).
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  • 14 h 25 - 14 h 50 : Calcul scientifique sur FPGA
    Matthieu Haefele, Université de Pau et des Pays de l'Adour, CNRS
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  • 14 h 50 - 15 h 15 : Simulation du collapse d'une bulle à l'aide d'un supercalculateur hybride
    Rémy Dubois2, Eric Goncalves3, Philippe Parnaudeau1

    1 : Institut Pprime,     Université de Poitiers, CNRS
    2 : IDRIS, CNRS
    3 : Institut Pprime, ISAE-ENSMA, CNRS
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  • 15 h 15 - 15 h 30 : Vents magnétiques et disques de transition
    Etienne Martel, Geoffroy Lesur, Institut de Planétologie et d'Astrophysique de Grenoble, Université Grenoble Alpes, Univ. Grenoble Alpes, CNRS, IPAG
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  • 15 h 30 - 15 h 55 : Plongement de texte de brevets et optimisation de calcul d'indicateurs
    Ziad Kachouh  1, Patrick Bousquet-Melou  2, Aymeric Le Nepvou De Carfort  1, Hermann Woehrel  1 , Jean-Marc Deltron  3 , Dominique Guellec  1

    1 : Hcéres
    2 : Criann
    3 : Université de Strasbourg
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  • 15 h 55 - 16 h 25 : Pause
  • 16 h 25 - 16 h 50 : SILECS/SLICES
    Christian Perez, Inria
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  • 16 h 50 - 17 h 15 : Reproductibilité et portabilité des performances
    Ludovic Courtès, Inria Bordeaux - Sud-Ouest
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  • 17 h 15 - 17 h 30 : Energy scope : un outil dédié au calcul haute performance pour mesurer le profil énergétique d'une application
    Hervé MATHIEU, Inria Bordeaux - Sud-Ouest
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  • 17 h 30 - 17 h 55 : "Digital Staging" ou comment faire offrir de nouveaux services avec du vieux matériel.
    Emmanuel Quemener, Centre Blaise Pascal  (CBP), École Normale Supérieure – Lyon
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Mercredi 15 décembre 2021 - matin

  • 9 h - 9 h 25 : France Grilles : 10 ans de services aux utilisateurs
    Vincent Breton  1, Laurent Caillat-Valet  2, Sorina Camarasu-Pop  3, Cyril L'orphelin  2, Gilles Mathieu  4, Jérôme Pansanel  5, Geneviève Romier  2

    1 : Laboratoire de Physique de Clermont, CNRS IN2P3, Université Clermont Auvergne
    2 : Centre de Calcul de l'N2P3,     IN2P3, CNRS
    3 : CREATIS, Univ. Lyon, INSA‐Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, UJM-Saint Etienne, CNRS, Inserm
    4 : DSI, INSERM
    5 : Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien  (IPHC),     CNRS, Université de Strasbourg
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  • 9 h 25 - 9 h 40 : Les services DIRAC au CC-IN2P3
    Gino Marchetti  1 , Vanessa Hamar  1, Andrei Tsaregorodtsev  2, Ghita Rahal  1

    1 : Centre de Calcul de l'N2P3, IN2P3, CNRS
    2 : Centre de Physique des Particules de Marseille, Aix Marseille Université, CNRS IN2P3
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  • 9h40 - 9 h 55 : MMO : l'observatoire multi-messager du FACe
    Cécile Cavet  1, Andrii Neronov  1 2, Denys Savchenko  1

    1 :  AstroParticule et Cosmologie,     Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives, CNRS IN2P3, Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres, Université de Paris
    2 : Université de Genève
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  • 9 h 55 - 10 h 10 : Intégration et déploiement continus sur VIP
    Axel Bonnet, Gaulthier Martin, Sorina POP, Frederic Cervenansky, CREATIS, Univ. Lyon, INSA‐Lyon, Université Claude Bernard Lyon 1, UJM-Saint Etienne, CNRS, Inserm
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  • 10 h 10 - 10 h 25 : MNHN-Tree-Tools: From sequences to phylogeny
    Thomas Haschka, Christophe Escudé, Loic Ponger, Julien Mozziconacci, Muséum National d'Histoire Naturelle (MNHN)
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  • 10 h 25 - 10 h 55 : Pause
  • 10 h 55- 11 h 10 : Orchestration de conteneurs, Cloud, et Pétaoctets de données : l'exemple du Rubin Observatory
    Fabrice Jammes  1, Bastien Gounon  2, Fabio Hernandez  2 , Sabine Elles  3, Dominique Boutigny  3

    1 : Laboratoire de Physique de Clermont, CNRS IN2P3, Université Clermont Auvergne
    2 : Centre de Calcul de l'N2P3, IN2P3, CNRS
    3 : Laboratoire d'Annecy de Physique des Particules, CNRS IN2P3, Université Savoie Mont Blanc
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  • 11 h 10 - 11 h 25 : Porting an Asteroseismology Code on GPU thanks to MAGMA library
    Alejandro Estana  1 2, Daniel Reese  3, François Lignières  1, Jérôme Ballot  1

    1 : Institut de recherche en astrophysique et planétologie (IRAP), CNRS, Observatoire Midi-Pyrénées, Université Paul Sabatier (UPS) - Toulouse III, CNES
    2 : Laboratoire de Physique Théorique, CNRS, INSA, Université Paul Sabatier
    3 : LESIA, CNRS
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  • 11 h 25- 11 h 40 : Déploiement de serveurs et de conteneurs GPU avec le service FG-Cloud
    Jérôme Pansanel  1 , Vincent Negre  2 , Ayoub Nachite  3, Marie Weiss  3

    1 : Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien  (IPHC), CNRS, Université de Strasbourg
    2 : LEPSE, INRAE, Montpellier SupAgro
    3 : EMMAH, INRAE, Université d'Avignon et des Pays de Vaucluse
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  • 11h40 - 12 h 05 : Démonstration : Automatiser ses déploiements applicatifs GPUs avec des conteneurs dans un environnement multi-cloud
    Rémi Cailletaud  1 , Yannis Govinda  2, Jérôme Pansanel  2

    1 : Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble, Université Grenoble Alpes,  CNRS, Institut de Recherche pour le Développement, Météo France, INRAE
    2 : Institut Pluridisciplinaire Hubert Curien  (IPHC),     CNRS, Université de Strasbourg
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  • 12 h 05 - 14 h : Pause déjeuner

Mercredi 15 décembre 2021 - après midi

  • 14 h - 14 h 25 : Cellule Data Grenoble Alpes : accompagnement sur les données de la recherche

    Violaine Louvet  1, Lucie Albaret  2, Arnaud Alexis  1

    1 : GRICAD, Université Grenoble Alpes, Institut polytechnique de Grenoble, Inria, CNRS
    2 : SICD Université Grenoble Alpes
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  • 14h 25 - 14h50 : Prototype de plateforme contribuant à la Science Ouverte par la valorisation de données et pratiques interdisciplinaires.
    Pascal Dayre  1, Nathalie Aussenac 1, Michelle Sibilla  1, Ba-Huy Tran 1, Emilie Lerigoleur  2, Franck Ravat  1 , Amina Annane  1, Cassia Trojahn  1, Ghita Amal 1, Weihao Xu  1, Lise Kleiber  1, Alexandre Champagne  1, Louis Mendy  1 , Datacore Datanoos 3, Data Driihm Labex Driihm 4

    1 : IRIT, CNRS, Université Paul Sabatier
    2 : Géographie de l’Environnement, CNRS, Université Toulouse - Jean Jaurès
    3 : Université de Toulouse
    4 : CNRS INEE
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  • 14 h 50 - 15 h 05 : Using OAIS reference model for storing and preserving large amounts of scientific data
    Yonny Cardenas, Centre de Calcul de l'N2P3, IN2P3, CNRS
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  • 15 h 05 - 15 h 20 : Using DMP machine-actionable with research data repositories
    Yonny Cardenas, Centre de Calcul de l'N2P3, IN2P3, CNRS
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  • 15h20 - 15 h 45 : Retour d'expérience d'utilisateur : portage VASP-GPU@JEAN-ZAY Grand Challenge : IonicLiquid@Graphene
    Iann Gerber 1, Nicolas Renon 2, Franck Jolibois 1, Céline Merlet  3

    1 : Laboratoire de physique et chimie des nano-objets, INSA - Toulouse, Université Paul Sabatier-Toulouse III, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CNRS
    2 : Mésocentre de calcul CALMIP, Institut National Polytechnique de Toulouse, Université Paul Sabatier-Toulouse III, CNRS, INSA - Toulouse
    3 : Centre inter-universitaire de recherche et d'ingénierie des matériaux, Université Paul Sabatier-Toulouse III, Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, CNRS, Institut National Polytechnique de Toulouse
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  • 15 h 45 - 16 h : Eli: plateforme de fouille de données à hautes performances sur Kubernetes
    Bruno Bzeznik, Oliver Henriot
    GRICAD, Université Grenoble Alpes, Institut polytechnique de Grenoble, Inria, CNRS
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  • 16 h - 16 h 15 : Clôture
    Geneviève Romier, Didier Rebeix
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Posters seuls

    • HW/SW co-design pour SKA - Poster
      Shan Mignot, Laboratoire Lagrange, Observatoire de la Cote d'Azur, Université Côte d'Azur (UCA), Institut national des sciences de l'Univers
    • The TREX Center of Excellence : Quantum Monte Carlo for the exascale - Poster
      Vijay gopal CHILKURI 1, Cedric Valensi 2, Pablo de Oliveira Castro 2, William Jalby 2, Anthony Scemama 3

       1 : Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques, Université Toulouse III - Paul Sabatier
       2 : Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines
       3 : Laboratoire de Chimie et Physique Quantiques, CNRS
    • Vers une offre de service "informatique scientifique" à l'Inserm - Poster
      Gilles Mathieu, Daniel Salas, Yosra Sanaa, Dominique Pigeon, Fanny Brizzi
       Département du Système d'Information de l'INSERM
    • Utilisation du Text Data Mining pour déduire la place d'un chercheur dans une publication - Poster Daniel Salas, Département du Système d'Information de l'INSERM
    • PCSC : le Portail pour le Calcul, le Stockage et le Cloud - Poster
      David Benaben 1, Damien Berry 3, Alexandre Dehne-Garcia 4, Cyril Jousse 5, Emilie Lerigoleur  6, Tovo Rabemanantsoa  7, Jean-François Rey  8, Sandrine Sabatié  9, Daniel Salas  10, Martin Souchal  11, Oana Vigy  12 
      1 : INRAE, UMR 1332 de Biologie du Fruit et Pathologie
       3 : Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'environnement, INRAE
       4 : Direction pour la Science Ouverte, Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement, Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques, INRAE, Université de Montpellier, Institut de Recherche pour le Développement, Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier
       5 : Institut de Chimie de Clermont-Ferrand, CNRS, Université Clermont Auvergne, Institut national polytechnique Clermont Auvergne, Université Clermont Auvergne
       6 : Géographie de l'environnement, CNRS, Université Toulouse - Jean Jaurès
       7 : Direction pour la Science Ouverte, INRAE, ISPA, Bordeaux Sciences Agro
       8 : Biostatistique et Processus Spatiaux, INRAE
       9 : UR ETTIS, INRAE
       10 : DSI, INSERM
       11 : AstroParticule et Cosmologie, Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives, IN2P3, Observatoire de Paris, Université Paris sciences et lettres, CNRS, Université de Paris
       12 : Institut de Génomique Fonctionnelle, CNRS, INSERM, Université de Montpellier
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